Sveučilište je ustrojeno znanstveno­nastavnim sastavnicama (sveučilišni odjeli) te drugim sastavnicama i ustrojstvenim jedinicama.

Sastavnice su Sveučilišta odjeli koji su strukturirani po kriteriju klasifikacije znanosti, po područjima (društveno, humanističko, umjetničko i biotehničko) i poljima (ekonomija, odgojne znanosti) tako da se djelatnost povezuje u nastavnoj i istraživačkoj djelatnosti. Odjeli su strukturirani uvažavajući znanstvene i druge kriterije, ali i specifičnosti akademskoga i društvenoga konteksta Sveučilišta.

Sveučilište se organizira po principu integrirane strukture, primjenjujući odjelski tip organizacije sa zajedničkim službama, što omogućuje efikasan i kvalitetan način ostvarenja misije, ciljeva i strategije razvoja.

• Fakultet ekonomije i turizma "Dr. Mijo Mirković"
• Fakultet za odgojne i obrazovne znanosti
• Filozofski fakultet
• Muzička akademija u Puli
• Odjel za interdisciplinarne, talijanske i kulturološke studije
• Odjel za informacijsko-komunikacijske tehnologije
• Odjel za prirodne i zdravstvene studije
• Centar za kulturološka i povijesna istraživanja socijalizma
• Sveučilišna knjižnica
• Studentski centar
• Centar za kompetencije u obrazovanju